הרב מרדכי ברויאר נולד בגרמניה לאחת המשפחות המפורסמות ביהדות האורתודוקסית הגרמנית. בגיל 13 עלה הרב ברויאר עם משפחתו לארץ ישראל. היה מחנך ומורה ושימש מפקח ארצי להוראת תורה שבעל פה במשרד החינוך. לאחר מכן לימד תנ"ך במוסדות תורניים על- תיכוניים. ב- 1999 זכה הרב ברויאר בפרס ישראל לספרות תורנית על מחקריו במקרא.
הרב ברויאר גילה כי הנוסח המקובל של המקרא בקהילות ישראל, מתאים כמעט לחלוטין לנוסח שקבע על סמך כתבי יד, ובמיוחד לנוסח של כתר ארם צובא שנחשב למדויק ביותר. הרב ברויאר פיתח גם את "שיטת הבחינות" לפרשנות התורה, שיטה המתמודדת מתוך השקפה דתית עם ביקורת המקרא. יחד עם בן דודו, פרופ' מרדכי ברויאר תרגם מגרמנית לעברית את הפירוש לתורה של אבי-סבו, הרב שמשון רפאל הירש. בנוסף היה אחד מחברי המערכת של הפירוש "דעת מקרא" וכן פרסם עשרות מאמרים בכתבי עת רבים. בזכות שיטת עבודתו הקפדנית והמדויקת התקבלו חידושיו ומחקריו גם על דעת חוקרים באוניברסיטאות.
