המיון על פי גובה מחלק את העננים לפי הגובה שלהם מעל הקרקע: נמוך, בינוני או גבוה.
עננים נמוכים - נקראים לפי הצורה, כלומר: ענן ערמתי נמוך נקרא "קומולוס" וענן שכבתי נמוך נקרא "סטרטוס".
עננים בינוניים (אלטו) - ענן ערמתי בינוני נקרא "אלטוקומולוס" וענן שכבתי בינוני נקרא "אלטוסטרטוס".
עננים גבוהים (צירוס) - ענן ערמתי גבוה נקרא "צירוקומולוס" וענן שכבתי גבוה נקרא "צירוסטרטוס".